六盘山的南部地区分布着大量的野生和家种的中药材，是宁夏药材资源丰富的产区。据普查，这里药物标本有５５１种，分属９５科，可供药用的有４３９种，分属９１科，其中常用药约有１５０种。分布量较大的有黄芪、柴胡、桃仁、杏仁、南沙参、白藓皮、茵陈、苣蔴菜、牛蒡于、车前子、葶苈子、青蒿、艾叶、赤芍、白芍、什麻、地骨皮、萹着、益母草、穿地龙、铁棒棒、知母、牧马豆、地构菜、五竹、麻黄、地榆、龙牙草、荆芥、地椒等，经济价值较高的有枸杞、甘草、贝母、元胡、党参、黄芪、银柴胡等；目前尚未作中药使用，今后将成为使用价值较高的药材有沙棘、铁棒锤、祖师麻、刺五加、红三七等。
    六盘山南部山区适宜中药材的生长，许多农民有种植中药材的习惯和经验。近年来，他们积极引种新品种，把野生变家种，扩大种植面积，使银柴胡、半夏、六盘山贝母、甘草、枸杞等传统药材的产量不断提高，不仅满足了宁夏本区使用，还向外省区销售。
    银柴胡能够甘微寒，清虚热凉血，用于阴虚发热、骨蒸劳热、小儿瘠热等症。它是由宁夏半荒漠地区引种到六盘山区的，生长良好，产量高，经济效益显著，年产量在２万公斤左右，绝大部分用于外销。半夏原是野生品种，１９８６年在宁夏泾源县变为家种。家种后年产８万公斤，很有发展前途。半夏辛温，具有燥温化痰，降逆止呕、消痞散结之功能，多用于痰多咳喘、痰饮眩悸、风痰眩晕、痰厥头痛、呕吐反胃、胸院痞闷等症。
    六盘山贝母是六盘山区的特产，质量可与川贝媲美。它苦甘微寒，祛痰止咳，对于慢性气管炎、肺结核、颈淋巴结核、乳汁不通、乳腺炎有较好的疗效。现在，六盘山贝母的开发和利用已经得到人们的重视，径源、隆德等县正在积极进行野生变家种的工作，进一步提高它的产量与质量。